Может быть причина похожа на мою.
Была схожая ситуация.
Насколько я понял typo3 хранит всю верстку в базе.
То есть есть шаблон верстки с какой нужно создать объект.
После создания объекта файл вообще можно удалить.
И последователям, в основном новеньким, уже будет трудно что либо сделать, суть уловили я думаю.
После того как вы поправили верстку, нужно в админке в TemplaVoila (у меня так), обновить объект.
Но это все лично моя ситуация. И возможно я не так изложил ответ.
Поправьте знатоки.

Т.е. что получается, страница отрендерилась и файл шаблона более не нужен? так что ли?

Я пробовал удалять свои файлы, что бы положить сайт, что бы как то поймать где же эта верстка.
В итоге что искал нашел в базе и далее с помощью данного форума истину.

Как-то очень странно получается:

1. Я переименовал файл главного шаблона = сайт перестал грузиться
2. Удалил из шаблона всё содержимое, сохранил - сайт НЕ грузится.
3. Написал в шаблоне "22", сохранил - на сайте НЕ показывается то, что я написал.
4. Правки шаблона не действуют.

Отсюда вывод: шаблон всё-таки рендерится из ФС, но вот что за фишка заставляет игнорить мои правки?.....

Кажется я уловил суть проблемы..... нужно каждый раз при правке вёрстки говорить: "Кеши - очистить все кеши" :) тогда всё работает. Я просто раньше работал с CMS, но как правило всё это ловилось на ходу. Первый такой затык был в джумле (там тоже надо было после каждой вёрстки чистить кеш, что очень неудобно). Ну а здесь, видимо, из-за массивности самой системы кешируется всё что может и не может кешироваться :)

Для разработки можно добавить в TS config.no_cache = 1 и не надо будет каждый раз на кнопку жать. Потом в ноль сбросить для продакшн версии.