Всё равно. Сначала всё хорошо. Но допустим время жизни кук кончается (ну допустим поспал я ночку, и не ходил ни на тот, ни на другой сайт) - в админку domen.ru (www.domen.ru) захожу, а админка site3.domen.ru снова ловит куку от основного домена. То есть ошибка логина пароля не вываливается, просто рефрешит на окно логин-пароля. И так до тех пор, пока не уберу куки be_typo_user (их должно быть две?) и typo3-login-coociecheck для сайта site3.domen.ru.
Проблемка на данный момент не из разряда особо важных, однко на будущее может принести неприятности. То есть: стоит многосайтовая установка (домен с поддоменами), и отдельно - поддоменом test - установка для тестирования всего и вся, прежде чем это устанавливать на основной сайт.