Не рано ли переходить на utf-8 в 3.6.0
 

Ведь весь контент хранится в MySQL, которая, как изветсно, до сих пор не имеет поддержки utf-8. Стало быть не будет правильно работать сортировка и регистронезависимый поиск в таблицах контента.
Какие еще могут быть подводные камни при переходе на utf-8?

Да, эти проблемы пока действительно существуют. Версия 4.1 полностью поддерживает utf-8, к сожалению пока только на стадии бета. Небольшие проблемы есть пока в бэкенде, например названия страниц сокращаются некорректно - отрезается часть байта и на последнем месте возникает совсем другой знак. Пока больше ничего не заметил. Этот форум работает больше полугода на utf-8. Поисковики узнают все корректно, по крайней мере Яндекс и Рамблер. Сейчас посмотрел - Апорт выдает только салат.