Нет, пока что так сделать к сожалению нельзя - параметр uploadfolder в TCA не может быть перекрыт TSConfig'ом:
http://bugs.typo3.org/view.php?id=5623
Видимо, единственный выход из такой ситуации - использование DAM (совместно с изменяющим TCA tt_content'a для использования в DAM экстеншеном).