Спасибо за подсказку, с пустого поля всё и началось.
Код:
$sql = "INSERT INTO tt_content
SET pid = '" . $uidNew . "',
sorting = '" . $row['sorting'] . "',
CType = '" . $row['CType'] . "',
header = '" . mysql_escape_string($row['header']) . "',
bodytext = '" . mysql_escape_string($row['bodytext']) . "',
list_type = '" . $row['list_type'] . "',
tx_pagephpcontent_php_code = '" . mysql_escape_string($row['tx_pagephpcontent_php_code']) . "',
tstamp = '" . time() . "',
l18n_diffsource = ''";
Вот что я заполняю. В row данные из старой бд.
Да, похоже требуется запись в sys_refindex.
После переноса из Non-used на страницу для контента была создана запись в sys_refindex.