То что у вас получается это закономерно. При обработке шаблона (TS.TEMPLATE) все относительные ссылки преобразовываются и к ним добавляется префикс заданный вами в параметрах TEMPLATE.
Простейший вариант решения - прописать полную ссылку с
http://...
Вопрос в том, зачем вы ссылки вручную прописываете?
Если вы хотите вставить ссылку на конкретную страницу в конкретное место шаблона так сказать TYPO3-way, то в шаблоне вместо <a>...</a> вставьте ###PAGE_XXX_LINK###, а в TS напишите примерно так:
Код:
page = PAGE
page.10.marks.PAGE_XXX_LINK = TEXT
page.10.marks.PAGE_XXX_LINK.value = Текст ссылки
page.10.marks.PAGE_XXX_LINK.typolink.parameter = 409
Так ссылка будет создана по всем TYPO3 правилам и через RealURL (если есть).