[Ивано++]

SSI - без TYPO3 работает?

Не разу не использовал SSI и не знаю работает ли он в *.php файлах, но возможно есть проблема в указании путей к файлам, т.к. TYPO3 скрипт идет от /index.php, а файлы лежат у Вас скорее всего в fileadmin/.