Если опустить все выше названные причины - есть другая одна очень важная причина (и это не политика, не мистика, и не другое что может придти в голову) - почему этого не стоит делать - менять эту папку...
При разработке расширений - при указании путей не все проганяют путь к классам/изображениям/документам и прочим вещам через переменную "TYPO3_mainDir" - а пишут просто:
/typo3temp/...
../typo3/...
и прочее...
По этой причине - это уже есть вероятность того, что Ваш сайт будет работать не правильно - т.е. минимум 50%/на 50%.
- и будет как в анекдоте - "Пацеент скорее жив, чем мертв"....
В чем такая потребность то обозначена?