Now we are in the situation that 3 years later (we had 4.6, 4.7, 6.0, 6.1) lots of methods are finally really gone. So for the first time, people upgrading from 4.5 to 6.2 will face some major breaking of their sites.
(Перевод). Сейчас мы находимся в ситуации, когда через 3 года (у нас было 4.6, 4.7, 6.0, 6.1) много методов, наконец, действительно ушли. Так в первый раз, люди, обновляющиеся с 4.5 до 6.2 столкнутся с некоторыми крупными нарушениями своих сайтов.
http://forge.typo3.org/news/649
Так, миграция с 4.5 на 4.7 была существенно затруднена из-за изменения тегов в редакторе, а с 4.х на 6.х - из-за изменения структуры папок.
ИМХО, чтобы не "столкнуться с некоторыми крупными нарушениями своих сайтов", нужно сесть на нопу и вручную перебросить контент в новую версию 6.х.