Всё в разных. JS вставляется через директивы TypoScript page.headerData и page.includeJS. (Гуглите и читайте TSRef или, если необходимо, введение в TypoScript)
PHP-код надо преобразовать в плагины, хотя обычно этого не требуется, т.к. для создания меню есть встроенные средства (HMENU/TMENU)
|