Правильная настройка базы MySQL 4.1 и TYPO3 4.0

[Valery Romanchev]

Возможно ли в одной БД (дереве) иметь два сайта - первый на windows-1251, второй на utf-8?

да, но при этом не будет нормально работать Index Search
Как это делать описано в доке по локализации.
Frontend Localization Guide
(свежая дока кстати)
http://typo3.org/documentation/docum...guide/current/

При том необходимо чтобы charset соблюдался и в BE - редактировать то сайт нужно в той же кодировке? То есть переключение BE charset-а должно происходить в зависимости от того в какой ветке?

В BE - будет один и тот же charset
(в базу все будет идти в utf8, юзер у которого руссий язык - будет в BE работать в windows 1251 - с этим подробно разбирался Павел Антонов - он вроде даже патч делал на эту тему... чтобы все-таки все было в utf8)
А для вывода в FE - для разных деревьев можно проставить разные кодировки - на лету идет конвертация